感染支原体衣原体后，不同部位感染症状有所不同。比如泌尿生殖系统感染时，男性可能出现尿道刺痒、灼痛，还可能有尿频、尿急，晨起尿道口有少量黏液性分泌物，有时呈脓性；女性感染后可能出现宫颈炎症，表现为宫颈充血、水肿等，还可能有阴道分泌物增多、下腹不适等。呼吸系统感染支原体时，主要症状有咳嗽，多为刺激性干咳，可持续较长时间，可能伴有发热，体温可在38℃左右，部分人还会有头痛、咽痛、肌肉酸痛等全身症状。
泌尿生殖系统感染症状表现
男性泌尿生殖系统： 初期会感觉尿道刺痒、灼热感，随着病情发展，会出现尿频、尿急，早晨起床时尿道口可能有少量稀薄的黏液性分泌物，严重时分泌物会变浓稠呈脓性。部分患者还可能出现会阴胀痛等不适。女性泌尿生殖系统： 感染后宫颈是常见受累部位，会有宫颈充血、水肿，宫颈表面可能有糜烂等表现。同时阴道分泌物会增多，可能出现异常气味，部分人会有下腹坠胀、疼痛等不适，有的还可能出现性交痛。
呼吸系统感染症状表现
咳嗽特点： 主要是刺激性干咳，咳嗽较为剧烈，一般没有明显的咳痰，或者仅有少量白色黏液痰。这种咳嗽可持续数周甚至数月，尤其在夜间或活动后可能会加重。全身症状： 多数患者会有发热，体温一般在38℃左右，也有部分人会出现高热情况。同时还可能伴有头痛、咽痛，全身肌肉酸痛等症状，比如感到乏力、四肢酸软等。
其他部位感染可能出现的症状
眼部感染： 如果是支原体衣原体感染眼部，可能会出现结膜炎，表现为眼睛充血、发红，有异物感，分泌物增多等，分泌物一般为浆液性或黏液性。咽部感染： 感染咽部时，可能会有咽部不适、疼痛，咽干等症状，部分人可能会出现咽部充血的表现。