一般情况下，怀孕49天内的宫内妊娠可以选择药流，怀孕70天内的宫内妊娠可以选择人流。药流和人流都有一定的风险，有可能会出现流产不全的情况，需要进行清宫手术。因此，流产是否能自己流干净，需要根据具体情况来判断。
药流是通过服用药物来终止妊娠，优点是没有宫腔操作，对子宫的损伤较小，缺点是药流的成功率较低，大约为75%左右，如果药流不全，需要进行清宫手术。
人流是通过负压吸引的方式将孕囊吸出，优点是成功率较高，一般可以达到90%以上，缺点是对子宫的损伤较大，可能会引起子宫内膜炎、宫腔粘连等并发症。
无论是药流还是人流，都需要在医生的指导下进行，并且需要在术后注意休息，加强营养，保持会阴部清洁，一个月内禁止性生活和盆浴。
此外，如果怀孕时间较长，或者存在药流或人流的禁忌症，如宫外孕、生殖道炎症、心脏疾病等，就不能选择药流或人流，需要进行其他的治疗方法，如引产。
总之，流产是否能自己流干净，需要根据具体情况来判断。如果对流产的相关问题有疑问，建议咨询医生，以获得专业的建议和指导。