习惯性腹泻是指反复发生、持续时间较长的腹泻情况，一般指病程超过4周或长期反复发作的腹泻。它可能由多种因素引起。
肠道功能紊乱导致
肠道菌群失调： 正常情况下，肠道内有多种有益菌群维持平衡。当某些因素如长期使用抗生素、饮食不均衡等，可能破坏肠道菌群平衡，有害菌增多，就容易引发习惯性腹泻。比如长期大量使用广谱抗生素后，约有20% - 30%的人会出现肠道菌群失调相关的腹泻。肠易激综合征： 这是一种常见的功能性肠道疾病，多见于中青年人群。患者的肠道对刺激较为敏感，比如食用生冷食物、精神紧张等情况，都可能诱发腹泻。典型的表现是腹痛、腹泻，排便后腹痛缓解，腹泻呈间歇性发作，但也可能转为习惯性腹泻。
器质性疾病影响
慢性肠炎： 包括慢性细菌性肠炎、慢性溃疡性结肠炎等。慢性细菌性肠炎可能是由于急性肠炎未彻底治愈，病菌持续在肠道内作怪。慢性溃疡性结肠炎则是一种自身免疫性疾病，肠道黏膜长期处于炎症状态，导致肠道功能紊乱，出现反复腹泻，可能还伴有黏液便、脓血便等情况。甲状腺功能亢进： 甲状腺激素分泌过多会加快身体的新陈代谢，包括肠道的蠕动速度。患者除了腹泻外，还常伴有多汗、心慌、消瘦等症状。甲状腺功能检查可发现甲状腺激素水平异常升高。
饮食因素相关
食物不耐受： 有些人对特定食物不耐受，比如乳糖不耐受。这类人群体内缺乏乳糖酶，无法正常消化牛奶、奶制品中的乳糖，食用后就会出现腹泻症状。还有些人可能对麸质不耐受，摄入含麸质的食物（如小麦、大麦等）后会引发肠道不适和腹泻。饮食不规律： 长期暴饮暴食、饥一顿饱一顿，或者经常食用辛辣、油腻、刺激性食物，会刺激肠道黏膜，影响肠道的正常消化吸收功能，久而久之容易导致习惯性腹泻。比如经常吃麻辣烫、油炸食品的人，肠道负担加重，更易出现腹泻情况。