乙肝疫苗注射后，多数人不会有明显不良反应，少部分人可能出现局部和全身反应。一般来说，局部反应较为常见，比如接种部位可能在24小时内出现轻微红肿、疼痛，这种情况通常1~2天就会自行消退。
局部不良反应：
接种部位红肿： 接种乙肝疫苗后，约有少数人会出现接种部位红肿的情况，一般红肿范围比较局限，直径多在2~5厘米左右，大多不需要特殊处理，保持局部清洁干燥即可。接种部位疼痛： 部分人会感觉接种部位有疼痛感，这种疼痛一般比较轻微，像针刺样或隐痛，多数人在1~3天内疼痛会逐渐减轻直至消失。
全身不良反应：
轻微发热： 少数人可能出现低热，体温一般在37.1~38℃之间，这种低热通常持续1~2天就会自行缓解，很少会超过3天。一般不需要服用退烧药，可通过适当休息、多喝温水来帮助体温恢复正常。乏力： 个别人会感到全身乏力，不过这种乏力感比较轻微，一般休息1~2天就能恢复，不会对日常生活造成严重影响。
特殊人群反应：
婴幼儿： 婴幼儿接种乙肝疫苗后，出现不良反应的情况相对较少，但也有个别婴幼儿可能会出现哭闹增多的现象，这可能是因为接种时的不适引起的，一般安抚后就能好转。过敏体质者： 过敏体质的人接种乙肝疫苗后，有极少数可能出现较为严重的过敏反应，比如皮肤出现大片皮疹、呼吸困难等，但这种情况非常罕见。如果出现严重过敏反应，需要立即就医进行救治。