阴茎有小颗粒可能是由多种原因引起的，以下是一些可能的情况：
1.珍珠状阴茎丘疹：这是一种常见的良性病变，表现为阴茎冠状边缘和冠状沟出现的珍珠状、半透明丘疹，可能与生理发育变异、局部刺激等有关。通常无自觉症状，对健康无影响，一般不需要治疗。
2.尖锐湿疣：由人乳头瘤病毒（HPV）感染引起，主要通过性接触传播。病变初期为单个或多个散在的淡红色小丘疹，质地柔软，顶端尖锐，后逐渐增大增多，可呈乳头状、菜花状或鸡冠状。可伴有瘙痒、疼痛、性交出血等症状。治疗方法包括物理治疗、药物治疗和免疫疗法等。
3.阴茎皮脂腺异位症：由于皮脂腺发育的生理性变型和皮脂腺增生所致。多见于包皮和龟头，表现为针头大小、孤立的、黄白色的小疙瘩，无自觉症状，可密集分布或融合成片。一般不需要治疗，也不会对健康造成影响。
4.传染性软疣：由传染性软疣病毒感染引起，可通过直接接触或间接接触传播。表现为半球形丘疹，中央有脐凹，可挤出白色乳酪样物质。治疗方法主要是刮除或挤出疣体，然后局部涂擦碘酊等。
5.其他：阴茎有小颗粒还可能是其他疾病的表现，如阴茎珍珠疹、扁平湿疣、鲍温样丘疹病等。
如果发现阴茎有小颗粒，建议及时就医，由医生进行详细的检查和诊断，并根据具体情况制定合适的治疗方案。同时，要注意保持阴茎清洁卫生，避免搔抓和刺激，避免不洁性生活。