手上长疣子可以通过多种方法治疗，常见的治疗方式包括药物治疗、物理治疗等。一般来说，药物治疗中常用的有维A酸类药物等，物理治疗如冷冻治疗等也较为常用。
药物治疗方式
外用药物： 维A酸类药物可以用于治疗手上的疣子，它能调节细胞的生长和分化。但使用时要注意避免接触正常皮肤，且可能会引起局部轻度的刺激症状，如烧灼感、红斑等。还有水杨酸，它可以通过促进角质剥脱来去除疣体，但使用过程中要观察皮肤反应，若出现严重的红肿、疼痛等不适要及时停用。免疫调节剂： 比如干扰素，它具有抗病毒和免疫调节的作用。可以通过局部注射等方式使用，但局部注射可能会引起疼痛等不适，而且需要在医生的操作下进行。
物理治疗方法
冷冻治疗： 是利用低温使疣体坏死脱落。一般冷冻后局部会出现水疱、肿胀等反应，大约1 - 2周水疱会干涸结痂，痂皮脱落后疣体可能随之去除。不过冷冻治疗可能需要多次进行，对于较大的疣体可能一次难以完全去除。激光治疗： 利用激光的高能量烧灼疣体，使其碳化坏死。激光治疗的优点是速度较快，但治疗后局部会有创面，需要注意保持创面清洁，避免感染，而且术后可能会有短暂的疼痛，创面恢复需要一定时间，一般1 - 2周左右。
手术治疗情况
对于一些较大的、药物治疗和物理治疗效果不佳的疣子，可以考虑手术切除。但手术切除后会有创面，需要注意预防感染，并且术后要注意休息，避免手部过度活动影响创面愈合。不过手术治疗相对来说创伤比冷冻、激光等稍大一些，在选择时要根据疣子的具体情况由医生评估是否适合手术。
日常注意事项
手上长疣子后要注意保持手部清洁卫生，避免搔抓疣体，防止自身接种传播，也就是防止疣子在手部其他部位或者身体其他部位传播。同时，要增强自身免疫力，比如保持良好的生活习惯，充足的睡眠、合理的饮食等，因为免疫力较低时可能更容易长疣子且不利于恢复。