药物流产的最佳时间是孕35-49天，其全过程如下：
一、第一天：早上8点需空腹遵医嘱服用米非司酮，且服用前后要保持空腹2小时。服药后部分人会有恶心的不良反应，此时可通过深呼吸或到透气处走动来缓解。米非司酮服用后会使胚胎停止发育。
1.服用时间：早上8点，且需空腹。
2.注意事项：服用前后空腹2小时；恶心时可采取的措施。
3.药物作用：让胚胎停止发育。
二、第二天：早晚需各遵医嘱服用米非司酮，同样服用前后要空腹2小时，早晚两次用药需间隔12小时，若出现特殊情况导致服药时间延迟或提前，应尽量控制在1小时内。
1.服用安排：早晚各一次。
2.注意要点：空腹2小时，间隔12小时，特殊情况时间变动范围。
三、第三天：服用米索前列醇需前往医院，且要早上空腹服用，以促进宫缩从而让胚胎顺利排出，用药后4-6小时会排出孕囊。服药45分钟后开始出现腹部疼痛，且疼痛会逐渐加剧，直至孕囊排出。孕囊排出后会有淤积的血块，当出血量与月经量相近时才算正常。10天后需到医院复诊，通过B超辅助检查是否排净。如遇极少数不良反应不必紧张，及时联系医生。
1.服用要求：去医院，早上空腹。
2.后续情况：4-6小时排出孕囊，45分钟后腹痛且加剧，排出孕囊及血块，出血量判断，后续复诊。
3.应对特殊情况：不良反应的处理。
总结概况提示：文章详细阐述了药物流产在不同时间的具体操作、注意事项、药物作用及后续情况等，对于进行药物流产的女性具有重要的指导意义，同时强调了遇到不良反应时的正确应对方式。