蛋白胆固醇低的原因可能包括运动量过大、饮食结构不合理、肝功能异常以及其他因素，需要依据具体情况进行处理。具体如下：
一、运动量过大：如果日常长时间进行高强度体育锻炼，可能导致体内脂肪消耗过多，从而引起蛋白胆固醇偏低。这种情况通常无需特殊治疗，适当减少运动量，一般可逐渐恢复。
二、饮食结构不合理：日常饮食较为清淡，摄入蛋白质和脂肪含量高的食物过少，会使体内蛋白质减少，脂肪含量也较低，进而造成蛋白胆固醇低。建议养成良好饮食习惯，适当多食用鱼肉、蛋类、瘦肉等富含蛋白质食物。
三、肝功能异常：患者若有肝炎、肝硬化等疾病，导致肝功能异常，可能影响低密度脂蛋白生成，出现低密度脂蛋白水平低下。可在医生指导下使用阿托伐他汀钙片、瑞舒伐他汀钙片、普伐他汀钠片等药物进行治疗。
四、其他因素：蛋白胆固醇低也可能是年龄增长、遗传因素、动脉粥样硬化、高血压、血脂调节功能异常等原因导致。如高血压患者要遵医嘱使用硝苯地平缓释片等药物控制血压，同时要戒烟、戒酒。蛋白胆固醇偏低人群可前往内分泌科就诊，完善肝功能、腹部彩超、CT等检查以明确情况。平常可多吃鸡蛋、牛奶、豆制品、鸡肉、鸭肉、猪肉等优质蛋白质食物补充身体所需营养。
总之，当发现蛋白胆固醇低时，要明确具体原因，并根据情况采取相应措施，同时注意饮食调整和生活习惯改善。