口腔溃疡可以使用局部用药来缓解，一般7~10天左右能好转。常见的治疗口腔溃疡的药物有以下几类：
局部消炎类药物
含漱剂： 如氯己定含漱液，它能减少口腔细菌，抑制菌斑形成，帮助减轻口腔溃疡处的炎症，一般每天含漱2~3次，每次10~15毫升。含片： 西地碘含片，含服后可在局部缓慢释放碘，有杀菌抗感染的作用，一次1片，一日3~5次。
止痛类药物
凝胶： 如苯佐卡因凝胶，能起到暂时止痛的效果，涂抹在口腔溃疡表面，用药后1~3分钟就能起效，缓解疼痛，但不建议频繁使用。喷雾剂： 口腔炎喷雾剂，直接喷于口腔患处，一日3~4次，小儿酌减，能起到清热解毒、消炎止痛的作用，缓解口腔溃疡带来的疼痛。
促进愈合类药物
散剂： 冰硼散，撒于患处，可清热解毒、消肿止痛，能促进口腔溃疡的愈合，一般一日数次。贴膜： 醋酸地塞米松粘贴片，贴于患处，它可以减轻炎症反应，促进溃疡愈合，一次1片，一日总量不超过3片，连用不得超过1周。
增强免疫力类药物
对于反复发生口腔溃疡且免疫力较低的人，可使用转移因子口服溶液等药物，它能调节和增强机体细胞免疫功能，使机体免疫状况改善，但这类药物需在医生指导下使用，儿童用药需谨慎，要根据体重等因素调整剂量。