治疗抑郁症的药物主要有以下几类。目前常用的抗抑郁药包括选择性5-羟色胺再摄取抑制剂（SSRI）等，这类药物约有60% - 70%的抑郁症患者使用后能获得一定疗效。
选择性5-羟色胺再摄取抑制剂
氟西汀： 通过抑制突触前膜对5-羟色胺的再摄取，增加突触间隙5-羟色胺浓度发挥抗抑郁作用，起效相对较慢，一般2 - 4周开始见效。但可能会有胃肠道不适等副作用，如恶心、腹泻等。帕罗西汀： 同样是抑制5-羟色胺再摄取，对伴有焦虑的抑郁症效果较好，但也可能引起嗜睡、口干等不良反应。
5-羟色胺和去甲肾上腺素再摄取抑制剂（SNRI）
文拉法辛： 能同时抑制5-羟色胺和去甲肾上腺素的再摄取，有不同剂量规格，抗抑郁的效果较为显著，不过初始用药时可能会出现血压轻度升高的情况，需要监测血压。度洛西汀： 也属于SNRI类药物，可用于治疗抑郁症，还能缓解伴随的焦虑症状，部分患者服用后可能出现头晕、乏力等反应。
去甲肾上腺素和特异性5-羟色胺能抗抑郁药（NaSSA）
米氮平： 能阻断中枢突触前α2肾上腺素受体，增加去甲肾上腺素和5-羟色胺的释放，从而发挥抗抑郁作用，它的副作用相对较少，比较常见的是可能引起嗜睡、体重增加等情况。
三环类抗抑郁药
阿米替林： 是较早使用的三环类抗抑郁药，对抑郁症有一定疗效，但副作用相对较多，比如抗胆碱能副作用，像口干、视物模糊、便秘等，还可能影响心血管系统，导致心率加快等。丙米嗪： 也是三环类药物，能改善患者的情绪低落、言语减少等抑郁症状，但同样存在抗胆碱能副作用以及可能影响心脏传导等问题。