颈源性头痛的药物治疗需根据具体情况选择，常用的药物有非甾体抗炎药等。一般来说，非甾体抗炎药是常用的缓解颈源性头痛的药物之一。
非甾体抗炎药类
非甾体抗炎药： 像布洛芬就属于非甾体抗炎药，它可以通过抑制前列腺素的合成来发挥抗炎、镇痛的作用，能有效缓解颈源性头痛带来的疼痛症状。另一种非甾体抗炎药： 萘普生也是常用的，它同样是通过抑制环氧化酶的活性，减少前列腺素合成，从而起到抗炎、止痛效果，对颈源性头痛有一定的缓解作用。
肌肉松弛剂类
乙哌立松： 它可以作用于中枢神经系统和血管平滑肌，起到放松肌肉的作用。颈源性头痛往往可能伴随颈部肌肉紧张，使用乙哌立松能缓解肌肉紧张，进而减轻头痛症状。氯唑沙宗： 氯唑沙宗能抑制脊髓和大脑皮质下的多突触反射，抑制致痛物质的释放，并且有肌肉松弛作用，对于因颈部肌肉紧张引发的颈源性头痛有一定的治疗作用。
神经营养药物类
甲钴胺： 它是一种内源性的辅酶B12，能参与一碳单位循环，在由同型半胱氨酸合成蛋氨酸的转甲基反应过程中起重要作用。颈源性头痛可能会对神经产生一定影响，甲钴胺可以促进神经髓鞘的合成，营养神经，有助于神经功能的恢复，从而缓解头痛相关的神经症状。维生素B1： 维生素B1是碳水化合物代谢所必需的酶的辅酶组成成分，它能维持神经系统正常功能。当颈源性头痛涉及神经因素时，补充维生素B1可以营养神经，辅助缓解头痛情况。