龟头炎的用药需根据不同病因来选择，一般细菌性龟头炎可选用抗生素类药物，比如莫匹罗星软膏等，通常用药后能在一定时间内改善症状，但具体效果因个体差异而异。
细菌性龟头炎用药
莫匹罗星软膏： 属于外用抗生素，能抑制细菌蛋白质合成，从而发挥杀菌作用，可用于革兰阳性球菌引起的细菌性龟头炎。夫西地酸乳膏： 对引起龟头炎的常见细菌有抑制效果，通过干扰细菌蛋白质合成来发挥抗菌作用。
念珠菌性龟头炎用药
克霉唑乳膏： 是抗真菌药物，能抑制真菌细胞膜的合成，影响其代谢过程，适用于念珠菌感染引起的龟头炎。咪康唑乳膏： 同样为抗真菌药，可抑制真菌的生长繁殖，对念珠菌等有较好的抗菌活性。
滴虫性龟头炎用药
甲硝唑： 属于硝基咪唑类药物，能阻碍滴虫的氧化还原反应，使原虫氮链发生断裂，从而发挥杀灭滴虫的作用，可用于滴虫性龟头炎的治疗。不过需要注意，孕妇及哺乳期妇女慎用。替硝唑： 也可用于滴虫性龟头炎的治疗，其作用机制与甲硝唑类似，能有效杀灭滴虫。
一般注意事项
在用药前，要保持龟头局部清洁卫生，可用清水清洗患处，但要避免使用刺激性强的清洁剂。同时，患病期间应避免性生活，防止交叉感染。如果是复发性龟头炎，要积极寻找可能存在的诱因，比如是否有包皮过长等情况，必要时可能需要考虑手术治疗等其他处理方式。另外，不同药物的使用都要在医生的指导下进行，不要自行随意用药，以免用药不当影响病情恢复甚至加重病情。