男性生殖器上长痘痘可能由以下几种情况引起：
一、毛囊炎：毛囊炎可在任何有毛囊的部位出现，当发生在男性生殖器上时，会因毛囊发炎而出现痘痘。通常还伴有疼痛、红肿、瘙痒等症状。对此可外用莫匹罗星软膏来改善。毛囊炎主要是由于细菌等病原体感染毛囊引起，生殖器部位毛发较多、局部潮湿、不注意清洁等都可能诱发毛囊炎。
二、尖锐湿疣：常见于有高危性生活的患者，主要表现为生殖器出现菜花状或鸡冠状的疣体，可能伴有瘙痒感，且随着病情发展，疣体还会增多、增厚。通常需要尽快清除疣体，可采用冷冻治疗、激光治疗等物理方式。尖锐湿疣是由人乳头瘤病毒（HPV）感染所致，主要通过性接触传播。
三、湿疹：湿疹属于一种皮肤炎症反应，可发生在任何部位，若出现在生殖器附近，就会导致生殖器长痘痘的情况。一般需要先清理局部的分泌物，可外用硼酸溶液、间苯二酚溶液等洗剂，必要时还可在医生指导下口服氯雷他定、西替利嗪等药物进行治疗。湿疹的发病原因较为复杂，可能与内外多种因素相互作用有关，如遗传、免疫、感染、环境等。
总之，当男性生殖器上出现痘痘时，要根据具体症状和表现来判断可能的原因，并采取相应的治疗措施。如果自己无法确定，应及时就医，以便明确诊断和进行恰当的治疗。