儿童发烧肚子疼可能由多种原因造成，比如常见的急性肠系膜淋巴结炎，多发生于7岁以下儿童，是由于上呼吸道感染后，病毒、细菌等病原体沿淋巴管到达肠系膜淋巴结，引起淋巴结发炎、肿大，导致孩子发烧、肚子疼，疼痛部位以脐周为主，呈阵发性。
肠道病毒感染引起
肠道病毒感染： 像柯萨奇病毒等肠道病毒感染儿童后，可引起发热，同时病毒感染肠道导致肠道功能紊乱，出现肚子疼。一般病程可能持续3 - 7天左右，孩子除了发烧、肚子疼，还可能伴有腹泻、呕吐等症状。细菌性痢疾： 由痢疾杆菌引起，多见于学龄前儿童。孩子会有发热，体温可达39℃左右甚至更高，同时出现肚子疼，多为左下腹疼痛，还会有黏液脓血便，大便次数频繁，一天可达十余次甚至更多。
外科急腹症相关原因
急性阑尾炎： 儿童也可能患急性阑尾炎，早期可能表现为肚脐周围疼痛，数小时后转移至右下腹，同时伴有发热，体温可在38℃ - 39℃左右，随着病情进展，腹痛会持续加重，压痛、反跳痛明显。肠套叠： 多见于2岁以内儿童，典型表现是突发的阵发性剧烈腹痛，孩子哭闹不安，伴有呕吐，之后可排出果酱样大便，同时多数会有发热情况，这是因为肠管套叠导致血液循环障碍，引起炎症反应从而发热。