阴道变短可能由多种原因引起。一般来说，随着年龄增长，女性进入更年期后，体内雌激素水平下降，会出现阴道黏膜变薄、弹性降低等变化，可能导致阴道变短，这是一种自然的生理衰老现象，通常在45岁~55岁左右的女性中较为明显。
生理性因素导致阴道变短
年龄相关变化： 女性进入更年期后，卵巢功能衰退，雌激素分泌减少。雌激素对维持阴道组织的弹性和厚度很重要，雌激素减少会使阴道黏膜萎缩，肌肉组织也会变得松弛，从而出现阴道变短的情况。一般女性45岁以后雌激素开始明显下降，阴道的这种变化就会逐渐显现。生育因素影响： 多次分娩尤其是难产、产程较长的女性，阴道会受到较大的机械性扩张，可能导致阴道弹性纤维断裂，进而使阴道松弛变短。有过2次以上顺产经历的女性，相对更容易出现阴道变短的情况。
病理性因素导致阴道变短
阴道炎症长期刺激： 一些慢性阴道炎症，如霉菌性阴道炎反复发作，炎症长期刺激阴道组织，会引起阴道黏膜充血、水肿，长期下来可能导致阴道组织增生、粘连等，进而使阴道变短。这种炎症如果持续1年以上没有得到有效控制，就可能对阴道结构产生影响。盆腔手术影响： 如盆腔恶性肿瘤手术切除部分阴道组织，或者因其他盆腔疾病进行的手术波及阴道，都可能导致阴道局部组织缺损或粘连，从而使阴道变短。例如因宫颈癌进行根治性子宫切除术时，可能会切除部分阴道，术后阴道长度会较术前缩短。
医源性因素导致阴道变短
放疗影响： 女性盆腔部位的恶性肿瘤进行放射治疗时，射线会对阴道组织产生损伤，导致阴道黏膜细胞受损，组织纤维化，进而使阴道变短。接受盆腔放疗后1年内，就可能观察到阴道有不同程度的缩短，而且这种缩短可能会随着时间推移逐渐加重。药物不当使用： 长期不合理使用某些阴道局部药物，可能会破坏阴道正常的酸碱平衡和组织环境，引起阴道组织的病理性改变，导致阴道变短。但这种情况相对较少见，不过一旦发生，影响较为持久。