碱性磷酸酶偏高是否有危害不能一概而论，一般来说，儿童骨骼发育期、孕妇等生理性因素导致的碱性磷酸酶偏高通常无明显危害，但由疾病引起的碱性磷酸酶偏高可能会有不同程度的危害。比如骨骼疾病时，像佝偻病、软骨病等，患者可能会出现骨骼疼痛、畸形等表现；肝胆系统疾病中，若因肝炎、肝硬化等导致碱性磷酸酶偏高，可能会有乏力、黄疸、肝区不适等症状。
生理性偏高的情况
儿童生长期：儿童在处于骨骼快速发育阶段时，碱性磷酸酶会生理性升高，这是正常现象，一般不会对身体造成危害。比如处于5~10岁左右的儿童，骨骼生长活跃，碱性磷酸酶可能会比成年人高出1~2倍，但随着年龄增长，会逐渐恢复正常。孕妇时期：女性怀孕后，胎盘会产生较多碱性磷酸酶，导致孕妇体内碱性磷酸酶偏高，这也是生理性的，通常在分娩后会逐渐恢复正常，对孕妇和胎儿一般无明显危害，但需定期监测。
病理性偏高的影响
骨骼疾病相关影响
佝偻病患儿：患有佝偻病的儿童，除了碱性磷酸酶偏高外，还会出现多汗、夜惊、方颅、鸡胸等症状，严重影响骨骼正常发育，若不及时治疗，可能会导致骨骼畸形，影响身体外观和运动功能。骨恶性肿瘤患者：骨恶性肿瘤患者体内碱性磷酸酶也会偏高，同时会有局部疼痛、肿块、病理性骨折等表现，会严重影响患者的生活质量和身体健康，还可能危及生命。
肝胆系统疾病相关影响
肝炎患者：肝炎患者肝功能受损时，碱性磷酸酶会升高，患者会有乏力、食欲减退、恶心、呕吐、黄疸等症状，若病情持续发展，可能会进展为肝硬化、肝衰竭等严重疾病，威胁生命健康。肝硬化患者：肝硬化患者碱性磷酸酶偏高时，常伴有肝区不适、腹胀、腹水、门静脉高压等表现，会影响肝脏的正常功能，降低患者的生活质量，且病情容易反复，治疗难度较大。