脑垂体囊肿的病因在临床实践中尚不完全明确。
一、可能与以前头部的外伤有关，脑垂体因外伤被移动到特定位置，致使一些细胞坏死，而后逐渐发展形成脑垂体囊肿。
1.头部外伤可能会对脑垂体造成影响。
2.这种影响可能导致细胞坏死。
3.细胞坏死经过一系列过程最终可能发展为脑垂体囊肿。
二、也可能是脑下垂体的某些内分泌细胞分泌相应激素后发生变异，从而形成脑垂体囊肿。
1.内分泌细胞在其中起到关键作用。
2.激素变异是一个重要环节。
当然，目前对于垂体囊肿形成的原因还不能完全确定，有些人可能先天就存在但后天逐渐发展并引发症状后才被发现，所以目前还没有确切的关于原因的明确声明。对于脑垂体囊肿，更重要的是早期发现和早期治疗。只有做到这一点，才更有利于整体疾病的治疗，而且目前脑垂体囊肿是可以治愈的。
总结概况提示：脑垂体囊肿病因不明，可能与头部外伤、内分泌细胞变异等有关，关键在于早发现早治疗，且其是可治愈的。