灰指甲的治疗方法有多种，一般可以通过外用药物、口服药物以及手术等方式来治疗。比如外用抗真菌药物治疗，常用的有阿莫罗芬搽剂等，不过通常需要连续使用几个月才能看到较好效果。
外用药物治疗
局部涂抹药物：常用的有30%冰醋酸溶液，需要长期涂抹，一般每周使用1 - 2次，连续使用3 - 6个月，但使用时要注意避免接触周围正常皮肤。阿莫罗芬搽剂：每周使用1 - 2次，它能渗透进甲板发挥抗真菌作用，一般坚持使用6个月左右可能有改善，但价格相对较高，一瓶可能几十元到一百多元不等。
口服药物治疗
抗真菌口服药：像伊曲康唑胶囊，采用冲击疗法，即每月服用一周，连续服用3 - 4个月。不过服用前需要检查肝功能，因为这类药物可能对肝脏有一定影响。还有特比萘芬片，一般每天服用一次，连续服用3个月左右，但同样要关注肝功能情况，且孕妇、哺乳期女性以及肝功能不全者要慎用。
手术治疗
拔甲术：过去常用，但现在应用相对减少，因为术后恢复时间较长，而且新长出来的指甲仍有可能再次感染真菌。手术需要在局部麻醉下进行，把病甲拔除，术后需要定期换药，大约需要2 - 3个月才能逐渐长出新甲，但术后要注意预防感染。激光治疗：利用特定波长的激光照射病甲，破坏真菌生存环境来达到治疗目的，一般需要多次治疗，每次治疗时间较短，可能间隔几周进行一次，不过费用相对较高，一次激光治疗可能几百元到上千元不等。
日常护理注意事项
保持足部干燥清洁：灰指甲患者要勤换袜子，选择透气性好的鞋子，每天洗脚后要把脚趾擦干，尤其是脚趾缝之间，避免真菌滋生。避免交叉感染：不要与他人共用拖鞋、脚盆等物品，家里其他人的足部用品也要分开使用，防止将真菌传染给他人，也避免自己再次感染。