跑完步后大腿内侧膝盖旁边疼，可能是以下原因引起：
1.运动过度：如果跑步时速度过快、距离过长或强度过大，可能导致大腿肌肉疲劳和酸痛。
2.肌肉拉伤：跑步过程中，大腿肌肉突然受到过度拉伸或扭曲，可能引起肌肉拉伤。
3.髂胫束综合征：这是由于髂胫束与股骨外上髁过度摩擦，导致的炎症和疼痛。
4.半月板损伤：半月板是膝关节内的软骨结构，跑步时可能因扭转、挤压等导致半月板损伤。
5.髌股关节综合征：髌股关节是膝关节的重要组成部分，过度使用或受伤可能导致髌股关节综合征。
针对以上原因，可以采取以下措施缓解疼痛：
1.休息：停止跑步，给大腿肌肉足够的休息时间。
2.冷敷：用冰袋或冷毛巾敷在疼痛部位，每次15-20分钟，每天数次。
3.按摩：轻轻按摩疼痛部位，缓解肌肉紧张。
4.拉伸：进行大腿肌肉的拉伸运动，帮助放松肌肉。
5.物理治疗：如超声波、电疗等，可促进恢复。
6.药物治疗：可使用非甾体类抗炎药（如布洛芬）缓解疼痛。
如果疼痛持续不减或加重，建议及时就医，进行详细的检查，以确定具体原因并采取相应的治疗措施。此外，在跑步前做好热身运动，逐渐增加跑步强度和距离，选择合适的跑鞋，也有助于预防疼痛的发生。