扁桃体肥大的治疗方法需根据具体情况而定。一般来说，轻度的扁桃体肥大可以先通过保守治疗观察，而中重度且影响呼吸、吞咽等功能的可能需要手术治疗。
保守治疗方式
药物治疗方面：
如果是细菌感染引起的扁桃体肥大，可能会使用抗生素。比如青霉素类抗生素，它通过抑制细菌细胞壁的合成来发挥杀菌作用，但对青霉素过敏者禁用。不过药物治疗主要是针对炎症等诱因进行控制，对于已经肥大的扁桃体组织本身缩小作用有限。
日常护理方面：
要让患者多休息，保证充足的睡眠，一般每天需要保证7 - 8小时以上的高质量睡眠，有助于身体免疫力的恢复。同时要注意口腔卫生，每天早晚正确刷牙，饭后用清水或淡盐水漱口，保持口腔清洁，减少细菌滋生，降低扁桃体再次发炎肿大的风险。还要让患者多喝水，每天饮水量最好保持在1500 - 2000毫升左右，保持咽喉部湿润，也有利于分泌物的排出。
手术治疗情况
手术适应人群：
当扁桃体肥大导致睡眠时打鼾明显，甚至出现呼吸暂停现象，或者严重影响吞咽功能，导致进食困难等情况时，就需要考虑手术治疗。一般来说，患者年龄如果在5岁以上，且符合手术指征，就可以考虑手术。
术后注意事项：
手术后患者需要禁食6小时左右，之后可以先吃一些温凉的流质食物，像米汤、豆浆等。要注意观察伤口情况，一般术后24小时内伤口会有少许渗血，这是正常现象，但如果渗血较多就要及时告知医生。同时要按照医生的要求服用抗生素等药物预防感染，一般需要服用3 - 5天左右。而且术后1 - 2周内要避免剧烈运动，防止伤口出血，饮食逐渐从流质过渡到半流质、软食，大约2周左右基本可以恢复正常饮食。
预防扁桃体肥大复发
增强体质方面：
平时要鼓励患者适当进行体育锻炼，比如每天进行30分钟左右的有氧运动，像慢跑、快走等，坚持锻炼可以增强身体的抵抗力，减少扁桃体发炎的几率，从而降低扁桃体再次肥大的风险。
避免诱因方面：
要让患者尽量避免接触过敏原，如果是过敏体质的人，接触花粉、尘螨等过敏原可能会诱发扁桃体发炎肿大，所以要尽量避免去花粉多的地方，保持室内清洁，勤换被褥等。还要注意天气变化，及时增减衣物，预防感冒，因为感冒容易引起扁桃体发炎，进而导致扁桃体肥大复发。