儿童自闭症的治疗通常需要综合多种方法，一般没有单一的“最有效”方法，而是需要根据儿童的具体情况制定个性化方案。例如，早期干预中，应用行为分析疗法（ABA）是常用的方法之一，有研究表明经过规范的ABA干预，部分儿童能在认知、社交等方面有明显改善。
康复训练干预
应用行为分析疗法（ABA）： 通过分解任务强化训练，帮助儿童掌握社交、沟通等技能。一般需要长期坚持，每周可能进行数十小时的训练。结构化教育（TEACCH）： 根据儿童的特点安排结构化的学习环境，帮助他们建立规律的生活和学习模式，促进其在语言、认知等方面的发展。
药物辅助治疗
抗精神病药物： 如利培酮，可用于改善自闭症儿童的易怒、自伤等行为症状，但需在医生严格评估后使用，因为可能存在一些副作用，如体重增加等。抗抑郁药物： 对于伴有抑郁症状的自闭症儿童，可能会使用一些抗抑郁药，但要谨慎选择，根据儿童的具体情绪状况由医生决定是否使用及选用何种药物。
家庭支持与参与
家长培训： 家长需要接受专业培训，学习如何在家中配合对儿童进行干预训练，掌握与儿童沟通、互动的方法，这对儿童的康复非常重要。营造支持环境： 家庭要为儿童营造温暖、稳定且有利于其发展的家庭氛围，积极参与到儿童的康复过程中，给予儿童足够的关爱和鼓励。
综合干预模式
多学科团队合作： 通常由医生、康复治疗师、心理学家等组成团队，为儿童制定综合的干预方案，涵盖医疗、康复、心理等多方面内容。例如，医生评估儿童的整体健康状况，康复治疗师进行针对性的运动、语言等康复训练，心理学家进行心理疏导等，多方面协同促进儿童的康复。