全血细胞减少可能由多种原因引起。比如再生障碍性贫血，这是一种骨髓造血功能衰竭性疾病，约半数以上的再生障碍性贫血患者起病急，贫血进行性加重，常伴有严重感染、内脏出血等，外周血全血细胞减少。
血液系统疾病相关原因
再生障碍性贫血： 是由于骨髓造血干细胞和造血微环境损伤，导致骨髓造血功能衰竭，出现全血细胞减少。患者会有贫血、出血、感染等表现，外周血中红细胞、白细胞、血小板都低于正常水平。骨髓增生异常综合征： 这是一组起源于造血干细胞的克隆性造血障碍疾病。患者骨髓中造血细胞出现病态造血，外周血表现为全血细胞减少，同时可能伴有贫血、感染、出血等症状，病情有向白血病转化的可能。
物理化学因素影响
放射性损伤： 长期接触大剂量的射线，如医疗辐射、职业辐射等，会抑制骨髓造血功能，导致全血细胞减少。例如在核事故中暴露于高剂量辐射的人群，容易出现这种情况。化学毒物： 一些化学物质也会损害骨髓造血。像苯及其衍生物，长期接触含苯的有机溶剂，如油漆、胶水等，会影响骨髓造血干细胞的功能，引起全血细胞减少。
感染性疾病因素
病毒感染： 某些病毒感染可导致全血细胞减少。例如EB病毒感染，部分患者在感染EB病毒后会出现外周血全血细胞减少的情况，还可能伴有发热、淋巴结肿大、肝脾肿大等表现；肝炎病毒感染也可能影响骨髓造血，导致全血细胞减少。细菌感染： 严重的细菌感染，如败血症，也可能引起全血细胞减少。细菌产生的毒素等物质会抑制骨髓的造血功能，使得红细胞、白细胞、血小板生成减少，从而出现全血细胞减少的现象。