药物流产吃药第三天一般2-6小时可排出孕囊。以下是具体阐述：
一、药物流产方法：是通过口服米非司酮和米索前列醇，来达到使胚胎死亡并排出体外终止妊娠的目的。
1.前两天口服米非司酮，会使子宫蜕膜变性坏死、宫颈软化。
2.第三天口服米索前醇，能让子宫兴奋、子宫收缩，以促使胚胎排出。
二、孕囊排出情况：通常在服药后的2-6小时排出，排出的孕囊呈现为白色泡泡状，表面有多个绒毛。
三、后续处理：排出孕囊后要复查B超判断是否有蜕膜残留，若发现有蜕膜组织残留，则通常需进行清宫；若出血多、腹痛加剧且孕囊未完全排出，也需进行清宫手术。建议前往医院，在专业医生指导下进行治疗。
总之，药物流产过程中需要密切关注孕囊排出情况及后续身体反应，严格按照医生指导进行操作和处理。