月经来了三天，但血量很少，只有一点褐色分泌物，可能与以下因素有关。
1.怀孕：怀孕后先兆流产、宫外孕等情况可能导致少量阴道流血，误以为是月经。可以通过验孕棒或早孕试纸检测，或就医进行血HCG检查，明确是否怀孕。
2.内分泌紊乱：如多囊卵巢综合征、高泌乳素血症等，可能导致月经失调，出现月经量少、褐色分泌物等症状。还可能伴有多毛、痤疮、肥胖等表现。
3.子宫内膜病变：如子宫内膜息肉、子宫内膜炎、子宫内膜粘连等，可能影响子宫内膜的正常脱落和修复，导致月经量少、褐色分泌物。
4.其他：如节育环移位、卵巢功能减退等，也可能引起月经异常。
此外，精神紧张、压力过大、过度节食、环境改变等因素，也可能影响月经。如果只是偶尔出现一次这种情况，可以先观察，注意休息，避免劳累和着凉。如果经常出现这种情况，或者伴有其他不适症状，建议及时就医，进行B超、性激素六项等检查，以明确原因，并在医生的指导下进行治疗。
在治疗方面，需要根据具体病因进行针对性治疗。以下是一些可能的治疗方法。
1.怀孕：如果是先兆流产，需要卧床休息，进行保胎治疗；如果是宫外孕，需要及时就医，采取相应的治疗措施，如手术或药物治疗。
2.内分泌紊乱：根据具体情况，可能需要使用激素药物进行调节，如避孕药、孕激素等。
3.子宫内膜病变：可能需要进行刮宫术、宫腔镜手术等治疗。
4.其他：根据具体情况进行相应的治疗，如取环、调整激素水平等。
需要注意的是，以上治疗方法仅供参考，具体治疗方案需要根据个人情况制定。同时，在治疗过程中，应遵医嘱按时服药，注意休息，保持良好的生活习惯，有助于促进身体的恢复。