扁桃体炎是扁桃体的炎症，多由病原微生物，如细菌、病毒等感染引起。咽炎则是咽部黏膜、黏膜下组织的炎症，同样可由感染、环境等因素导致。二者在发病部位、症状表现等方面有差异。
一、发病部位差异
扁桃体炎发病部位为扁桃体，位于口咽部两侧；咽炎发病部位是整个咽部，包括鼻咽、口咽和喉咽等区域。
二、症状表现不同
扁桃体炎患者常出现扁桃体红肿、疼痛，严重时可有扁桃体表面有脓性分泌物，还可能伴有发热、畏寒等全身症状；咽炎患者主要表现为咽部干燥、瘙痒、疼痛、异物感等，全身症状相对较轻，一般发热不明显或体温较低。
三、感染源特点
扁桃体炎的病原体以A组乙型溶血性链球菌较为常见；咽炎的病原体种类更多，除了病毒、细菌外，环境中的刺激性物质等也可引发，如长期吸入粉尘、化学气体等。
四、治疗侧重点
扁桃体炎治疗多需针对病原体进行抗感染治疗，如细菌感染时可能需用抗生素；咽炎治疗则需根据病因，若为感染因素同样抗感染，若是环境因素导致需改善环境，同时缓解咽部不适症状。对于儿童等特殊人群，需更加关注其症状变化，及时采取合适措施，因为儿童免疫力相对较弱，病情变化可能较快。