怀孕初期上厕所时出现褐色分泌物，可能是以下原因引起：
1.先兆流产：在怀孕初期，褐色分泌物可能是先兆流产的迹象。这可能是由于胚胎染色体异常、母体激素分泌不足、子宫畸形等原因导致的。孕妇可能还会伴有腹痛、阴道流血等症状。如果出现这些症状，应及时就医，医生一般会建议进行超声检查、孕激素水平测定等，以确定胎儿的情况。如果确诊为先兆流产，医生可能会建议卧床休息、使用孕激素等保胎药物进行治疗。
2.异位妊娠：受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，俗称宫外孕。宫外孕时，胚胎在子宫外发育，随着胚胎的长大，会导致子宫破裂、腹腔内出血等严重后果。宫外孕的早期症状之一就是阴道少量出血，颜色可为褐色。如果怀孕初期出现褐色分泌物，同时伴有腹痛、恶心、呕吐等症状，应高度怀疑异位妊娠的可能，及时就医。医生通常会通过超声检查、血β-HCG测定等方法来确诊。一旦确诊为异位妊娠，应尽早进行治疗，可选择手术治疗或药物治疗。
3.宫颈息肉：宫颈息肉是宫颈管黏膜的增生突出于宫颈外口形成的息肉。息肉质地脆弱，触碰后容易出血，表现为性生活或妇科检查后阴道出血，也可表现为褐色分泌物。如果怀孕初期出现褐色分泌物，同时伴有白带增多、发黄、有异味等症状，应考虑宫颈息肉的可能。医生一般会通过妇科检查来确诊。如果确诊为宫颈息肉，通常会在孕期进行息肉摘除术。
4.其他原因：除了上述原因外，怀孕初期上厕所时出现褐色分泌物还可能与其他因素有关，如着床出血、阴道炎、宫颈炎等。
总之，怀孕初期出现褐色分泌物是一种异常情况，需要引起重视。如果出现这种情况，建议及时就医，进行相关检查，以确定原因，并采取相应的治疗措施。同时，孕妇应注意休息，避免剧烈运动和性生活，保持心情愉悦，按时进行产前检查。