多年的扁平疣可通过多种方法来尝试根治，比如药物治疗、物理治疗等。一般来说，治疗方法的选择需根据个体情况而定，其中药物治疗有多种选择。
药物治疗有哪些
外用药物： 维A酸类药物是常用的外用药物，像维A酸乳膏，它可以调节细胞分化，抑制角质形成细胞的增殖，从而有助于扁平疣的消退，但使用时可能会有局部刺激等不良反应，比如用药部位可能出现红斑、脱屑等情况。干扰素凝胶： 具有抗病毒和免疫调节作用，能抑制病毒的复制，激活免疫系统来对抗感染扁平疣病毒的细胞，不过起效相对较慢，可能需要连续使用数周甚至数月才能见到明显效果。
物理治疗方式有哪些
冷冻治疗： 是利用低温使疣体坏死脱落。通常是用液氮接触疣体，一般1 - 2周左右疣体可能会脱落。但冷冻治疗可能会引起疼痛，而且部分人可能需要多次治疗才能完全去除疣体，治疗后局部可能会出现水疱、结痂等情况，要注意保持局部清洁，避免感染。激光治疗： 利用激光的高能量烧灼疣体，使其碳化坏死。激光治疗的速度相对较快，一次治疗可能就能去除较小的疣体，但对于较大或较多的扁平疣，可能需要多次治疗。治疗后局部会有创面，需要注意护理，防止感染，并且要避免日晒，以防留下色素沉着。
自身免疫调节很重要吗
自身免疫调节对于扁平疣的根治有一定作用。人体的免疫系统在对抗扁平疣病毒感染中起着关键作用。比如保持良好的生活习惯很重要，充足的睡眠有助于增强免疫力，一般建议成年人每天保证7 - 8小时的高质量睡眠。合理的饮食也很关键，要摄入均衡的营养，多吃富含维生素和蛋白质的食物，像新鲜的蔬菜水果、瘦肉、鱼类等，维生素C、维生素E等有助于增强免疫力，蛋白质是身体免疫系统的重要组成部分。另外，适当的运动也能调节自身免疫，每周可以进行至少150分钟的中等强度有氧运动，如快走、慢跑等，运动可以促进血液循环，增强身体的抵抗力，从而帮助身体更好地对抗扁平疣病毒，促进疣体的消退。