出血问题
肾穿刺后可能出现局部出血，多数为少量镜下血尿，通过卧床休息等一般能自行缓解。少数情况可能出现肉眼血尿，极个别严重时可能需要输血甚至介入治疗等处理，但发生概率较低。
感染风险
肾穿刺后有发生感染的可能，多为泌尿系统感染或肾脏周围感染。通过术前严格消毒、术后合理应用抗生素等措施可降低感染发生几率，一旦发生需积极抗感染治疗。
损伤周围组织
极个别情况下可能损伤周围组织，如肠道等，但这种情况非常罕见，在经验丰富的医生操作下发生风险极低。
对身体心理影响
部分患者可能因对肾穿刺的担忧等出现心理压力，不过这不属于身体的器质性后遗症，通过心理疏导等可缓解。对于儿童等特殊人群，肾穿刺操作需更加谨慎，术后要密切观察，因为儿童身体各方面发育尚未完全成熟，对穿刺的耐受和恢复情况需格外关注，要确保术后护理到位，减少不良情况发生。
