关键点：月经后第三天同房怀孕可能是月经周期短或排卵期提前导致，不同原因有不同处理方式，如怀孕后正常不用担心或选择流产等，要注意相关事项。
以下是详细阐述：
一、月经周期短：
月经后三天同房怀孕可能是由于月经周期较短引起。通常来说，如果月经周期在25天左右，那么月经干净3天后，与排卵期的距离相对较近。此时进行同房，就有可能出现怀孕的情况。这种情况下怀孕是正常的，表明卵巢功能处于正常状态。
二、排卵期提前：
因为卵子在体内可存活1至2天，精子能存活2至3天。若排卵期提前，那么在排卵期前后3至5天内同房，都有受孕的可能性。
如果患者打算留下胎儿，就需要按时服用叶酸，以预防胎儿出现畸形，同时要按规定进行产前检查。若不打算要这个孩子，可以在怀孕40天以上时到正规医院进行彩超检查，然后在医生的指导下选择适合自己的流产方式。在此期间，要注意保持心情舒畅，避免过度焦虑。
总结概况提示：月经后第三天同房怀孕的原因及处理方式，包括月经周期短和排卵期提前两种情况，以及怀孕后的不同选择和注意事项。