寻常疣的治疗方法有多种，其中物理治疗较为常用。一般来说，激光治疗是比较常见的方式，通过激光的能量直接破坏疣体，通常1 - 2次激光治疗可能使疣体脱落，但具体次数因个体情况而异。
物理治疗方法
冷冻治疗： 利用低温使疣体组织坏死脱落。通常每2 - 3周做一次冷冻，可能需要多次治疗才能完全去除疣体。治疗时局部会有疼痛、肿胀等反应，不过多数人可耐受。激光治疗： 借助激光的高能量瞬间汽化疣体。治疗过程相对较快，术后局部会有创面，需注意保持清洁，避免感染，一般1周左右创面可愈合。
外用药物治疗
水杨酸： 可以软化疣体，使疣体逐渐脱落。使用时要注意避免接触正常皮肤，一般每天涂抹1 - 2次，连续使用数周可能见效。维A酸乳膏： 通过调节表皮细胞的分化来发挥作用，对寻常疣有一定的治疗效果。使用时要在晚上睡前涂抹，且需避光，孕妇禁用。
免疫疗法
干扰素： 具有抗病毒和调节免疫的作用。可以局部注射干扰素，刺激机体的免疫反应来清除疣体，但可能会有局部红肿等不良反应，且治疗周期相对较长。卡介菌多糖核酸： 能调节机体免疫功能。通过肌肉注射，一般需要连续注射一段时间，可增强机体对病毒的抵抗力，辅助治疗寻常疣。