甲亢患者吃药三个月后变为甲减，通常有以下两种原因。
一、对于弥漫性毒性甲状腺肿的患者，在治疗甲亢期间，若抗甲状腺药物的剂量使用过大，就可能引发药物性甲减。弥漫性毒性甲状腺肿是一种自身免疫性疾病，会导致甲状腺激素分泌过多而引起甲亢。在使用抗甲状腺药物治疗时，需要严格控制剂量，根据患者的具体情况进行个体化调整。如果剂量过大，就可能过度抑制甲状腺功能，导致甲状腺激素合成和分泌显著减少，从而出现甲减的症状。
二、桥本甲状腺炎的患者可能会从甲亢转变为甲减。桥本甲状腺炎本身就会引起甲状腺功能的变化，其病程中可能会经历甲亢期、甲状腺功能正常期和甲减期。多数患者最终会发展为永久性的甲状腺功能减低。所以对于桥本甲亢的患者，在使用抗甲状腺药物时剂量要偏小，并且要密切、定期地复查甲状腺功能，以便及时发现甲状腺功能的变化并进行相应的调整。
总之，对于甲亢患者在治疗过程中变为甲减的情况，需要仔细分析原因，根据具体情况采取相应的措施，包括调整药物剂量、监测甲状腺功能等，以确保患者的甲状腺功能维持在正常范围内。