通常来说，新生儿做心脏彩超是安全的，不会有明显的副作用。但在某些罕见情况下，可能会出现以下情况：
1.短暂的不适感：在进行心脏彩超检查时，新生儿可能会感到短暂的不适，如哭闹、躁动等。这可能是由于检查过程中的声音、压力或体位改变引起的。但这种不适通常是短暂的，会很快消失。
2.低血糖：如果新生儿在检查前没有进食，可能会在检查后出现低血糖症状，如哭闹、颤抖、苍白等。因此，在检查前，医生通常会让新生儿进食。
3.感染：在进行心脏彩超检查时，需要使用耦合剂来保持探头与皮肤之间的良好接触。如果耦合剂没有正确处理，可能会导致感染。但这种情况非常罕见，医生会在检查前和检查后正确处理耦合剂，以减少感染的风险。
4.其他：在极少数情况下，可能会出现一些罕见的并发症，如心脏节律异常、低血压等。但这些情况非常罕见，医生会在检查前对新生儿进行全面的评估，并在检查过程中密切监测新生儿的生命体征，以确保检查的安全性。
需要注意的是，心脏彩超是一种非常重要的检查方法，可以帮助医生及时发现新生儿心脏结构和功能的异常。如果医生认为新生儿需要进行心脏彩超检查，家长应该积极配合医生的安排，确保检查的顺利进行。同时，家长也可以在检查前咨询医生，了解检查的过程和注意事项，以减轻自己的担忧。