短肠综合征的治疗包含多个方面。一般来说，短肠综合征的治疗需要综合多种手段，其中营养支持是重要的基础部分。
营养支持治疗
肠内营养： 在患者肠道功能允许的情况下，应尽早开始肠内营养。通常可以选择要素型或短肽型肠内营养制剂，通过鼻饲或经皮内镜下胃造瘘（PEG）等方式给予。一般建议每日提供足够的热量，约25 - 35千卡/千克体重，同时保证蛋白质、维生素、矿物质等的摄入。肠外营养： 对于肠道功能严重受损，无法进行有效肠内营养的患者，需要完全依赖肠外营养。要根据患者的具体情况计算营养物质的需求量，包括碳水化合物、脂肪、蛋白质、电解质、维生素等，一般需要在专业的营养支持团队指导下进行配置和输注，以维持患者的营养状况，避免出现营养不良相关的并发症。
药物辅助治疗
促肠道适应药物： 一些药物可以促进肠道的代偿性增生和适应。例如，生长激素可能有一定的作用，它可以促进肠道黏膜细胞的增殖，有助于肠道功能的恢复。不过，其使用需要严格掌握适应证和监测相关不良反应。胆盐重吸收调节剂： 短肠综合征患者可能存在胆盐丢失过多的情况，使用胆盐重吸收调节剂如考来烯胺等，可以减少胆盐在肠道的丢失，改善腹泻等症状。但使用时要注意药物的相互作用以及对脂溶性维生素吸收的影响。
手术治疗
小肠移植： 对于那些经过长期营养支持等治疗效果不佳，肠道功能无法恢复，并且出现严重营养不良、多器官功能衰竭等情况的短肠综合征患者，小肠移植可能是一种挽救生命的治疗手段。但小肠移植面临着免疫排斥、感染等诸多风险，需要严格评估患者的病情和身体状况，并且术后需要长期使用免疫抑制剂来预防排斥反应。肠道延长手术： 对于部分短肠综合征患者，还可以考虑肠道延长手术，通过外科手段将剩余的小肠进行适当的延长，以增加肠道的吸收面积，改善肠道功能。但这种手术有一定的适应证和技术要求，需要由经验丰富的外科医生进行评估和操作。