眼皮上长小水泡的原因主要有带状疱疹、睑板腺管堵塞等。具体如下：
一、带状疱疹：这主要是因为潜伏在体内的带状疱疹病毒，一旦人体免疫力在短期内明显下降，病毒就容易侵袭三叉神经，从而导致局部出现带状疱疹，也就是小水疱。除了眼睑周围有小疱疹外，此病症通常还伴有严重的眼睑皮肤疼痛。对此，患者可以及时进行抗病毒治疗，常用药物包括口服更昔洛韦胶囊、局部涂更昔洛韦凝胶、眼内点阿昔洛韦滴眼液等。
二、睑板腺管堵塞：睑板腺管的开口在睫毛根部下方，分泌泪液中的脂质成分。由于各种原因使得睑板腺管内液体变稠厚，眼皮处易形成脂质栓，表现为淡黄色小水泡，可能没有任何症状或者伴有轻微异物感。患者一般可以通过热敷、按摩眼睑等方法来促进脂质排出。
总之，眼皮上长小水泡需要根据具体病因进行针对性治疗。