先天性肛门直肠畸形可分为高位、中间位和低位。对于男性，高位包括肛管直肠发育不全、直肠前列腺尿道瘘、直肠闭锁；中间位包括直肠球部尿道瘘、直肠发育不全；低位包括肛门皮肤瘘和肛门狭窄。对于女性，高位包括肛管直肠发育不全、直肠阴道瘘、直肠闭锁；中间位包括肛管发育不全；低位包括肛门前庭瘘、肛门皮肤瘘、肛门狭窄以及泄殖腔狭窄等。
一、男性先天性肛门直肠畸形
1.高位
(1)肛管直肠发育不全：存在肛管和直肠的发育缺陷。
(2)直肠前列腺尿道瘘：直肠与前列腺部尿道之间存在异常瘘管。
(3)直肠闭锁：直肠完全阻塞不通。
2.中间位
(1)直肠球部尿道瘘：直肠与球部尿道有瘘道相连。
(2)直肠发育不全：直肠的发育不健全。
3.低位
(1)肛门皮肤瘘：肛门与皮肤之间有瘘道。
(2)肛门狭窄：肛门的孔径狭窄。
二、女性先天性肛门直肠畸形
1.高位
(1)肛管直肠发育不全：存在肛管和直肠发育上的问题。
(2)直肠阴道瘘：直肠与阴道之间有异常通道。
(3)直肠闭锁：直肠处于闭锁状态。
2.中间位
(1)肛管发育不全：肛管的发育不完善。
3.低位
(1)肛门前庭瘘：肛门与前庭部位有瘘管。
(2)肛门皮肤瘘：肛门和皮肤间存在瘘道。
(3)肛门狭窄：肛门较为狭窄。
(4)泄殖腔狭窄：泄殖腔部位狭窄。
总之，先天性肛门直肠畸形有多种分类和具体情况，不同性别和不同位置的畸形表现各异，这对于诊断和治疗方案的制定都具有重要意义。