大肠疱疹通常由单纯疱疹病毒感染引起，治疗上一般可通过药物等方式缓解症状，通常病程在1 - 2周左右。
药物治疗选择
抗病毒药物： 常用的有阿昔洛韦，它能抑制单纯疱疹病毒的DNA合成，起到抗病毒的作用，可减轻大肠疱疹的症状，缩短病程。还有伐昔洛韦，它是阿昔洛韦的前体药物，生物利用度比阿昔洛韦高，服用相对方便。对症药物： 如果大肠疱疹引起疼痛，可使用非甾体抗炎药，像布洛芬，能起到一定的止痛效果。若局部有继发感染，可能需要使用莫匹罗星软膏等抗生素软膏来抗感染。
日常护理要点
皮肤清洁： 要保持患病部位皮肤的清洁卫生，每天用温水轻柔地清洗患处，避免用刺激性强的肥皂等清洗，防止加重皮肤刺激。清洗后要轻轻擦干，保持干燥。避免搔抓： 大肠疱疹会引起瘙痒等不适，但一定要避免用手搔抓患处，因为搔抓可能会导致疱疹破裂，引起继发感染，还可能使病情加重，甚至留下疤痕。饮食注意： 患病期间要注意饮食清淡，多吃富含维生素的食物，如新鲜的蔬菜和水果，像橙子、西兰花等，有助于增强身体免疫力，促进病情恢复。同时要避免食用辛辣、刺激性食物，如辣椒、花椒等，这些食物可能会加重局部的炎症反应。
特殊人群注意事项
儿童患者： 儿童患大肠疱疹时，家长要更加留意。儿童皮肤比较娇嫩，护理时动作要格外轻柔。在药物使用上，要谨慎选择儿童适用的剂型，如儿童专用的阿昔洛韦制剂等，并且要在医生的指导下使用，因为儿童的肝肾功能等发育还不完善，药物代谢与成人不同。孕妇患者： 孕妇感染大肠疱疹需要特别谨慎。抗病毒药物的使用要权衡利弊，有些抗病毒药物可能会对胎儿产生影响。一般会先评估病情的严重程度，如果病情较轻，可能会先采取局部护理等保守治疗；如果病情较重，会在医生的严格评估下选择相对安全的药物进行治疗。