药物流产没有流干净可能产生多种不良影响，包括对子宫内膜造成伤害、引发宫腔感染、引发妇科疾病等。
一、对子宫内膜造成伤害：若药物流产不彻底，残留组织可能会对子宫内膜产生一定损害。当残留的组织进入宫腔且无法排出时，甚至可能植入宫腔。
二、引发宫腔感染：子宫腔内残留组织会导致阴道出血频繁、不规则出血，还可能引发感染，进而导致贫血。
三、引发妇科疾病：如果长时间未清理干净，容易使病原微生物感染，引发子宫内膜炎、盆腔炎等炎症性疾病，同时伴有如发烧、疲倦、严重腹痛、阴道内分泌异常分泌物等全身症状。
药物流产没有流干净的治疗方法如下：当残留小于1厘米时，可在医生指导下口服益母草颗粒、新生化颗粒等药物促进血液循环、清除血瘀，以帮助恢复子宫正常；如果超过1厘米，则需再次进行宫腔清理，以免残留物长时间存在于宫腔内而对身体造成损伤，影响日后妊娠。
总之，药物流产没流干净危害较大，要根据具体情况选择合适的治疗方法。