通常肛瘘手术后会有一些后遗症，包括肛门瘙痒、肛门括约肌功能失常、疾病复发等。
一、肛门瘙痒：如果肛瘘范围较大，术后手术疤痕会较大，这可能影响肛门闭合，导致直肠黏液渗出。要是患者不注重个人卫生，黏液就会刺激肛门，从而引发肛门瘙痒、潮湿等不适状况。具体来说，当肛瘘范围较大时，手术创口也会相应较大，愈合后形成的疤痕组织可能会使肛门的正常闭合功能受到一定程度的干扰。这样一来，直肠内的黏液就更容易渗出到肛门周围。而患者如果没有良好的卫生习惯，未及时清理这些渗出的黏液，就会让肛门长期处于被刺激的状态，进而产生肛门瘙痒、周围皮肤潮湿等一系列问题。
二、肛门括约肌功能失常：若肛瘘病变位置较高，手术中可能会对肛门括约肌造成损害，术后形成的疤痕也可能刺激括约肌，进而导致肛门失禁、排便障碍等不良现象出现。详细而言，在肛瘘病变位置较高的情况下，手术操作难度增大，可能难以避免地对肛门括约肌造成一定程度的损伤。而且，术后疤痕的形成和收缩也可能对括约肌产生持续的不良影响。这一系列因素综合起来，就可能使肛门括约肌的正常功能发生紊乱，表现为肛门失禁，即不能自主控制排便，或者出现排便困难等问题。
三、疾病复发：如果患者病情严重且瘘口较多，手术时可能出现病灶未清除干净的情况，之后瘘管可能会再次形成，导致疾病复发。当病情严重且瘘口数量多的时候，手术中完全清除所有病灶的难度会显著增加。可能会存在一些细小的瘘管或病灶未被彻底清理干净，这就为日后瘘管的再次形成和疾病的复发埋下了隐患。随着时间的推移，这些残留的病灶可能会逐渐发展和蔓延，重新形成瘘管，导致疾病再次出现。
建议患者在肛瘘手术后严格按照医嘱进行定期复查，平时也要特别注意肛周卫生，每天清洗肛周并增加更换衣物的频率，这样有助于降低出现后遗症的概率。此外，肛瘘手术还可能出现切口感染等后遗症，同样需要患者在术后严格遵循医嘱进行定期复查。要是患者在术后出现了后遗症，必须立刻就医并进行针对性治疗，以避免对健康造成更大的损害。
总之，肛瘘手术后要重视可能出现的后遗症，做好复查和卫生护理等工作，一旦发现异常要及时处理。