男生阴茎小可能有以下原因：一是尚未进入青春期；二是隐匿性阴茎；三是发育异常。建议前往正规医院明确具体病因。
一、尚未进入青春期。男生一般在12至18岁进入青春期，此时体内激素会发生变化，阴茎和睾丸开始显著增大，睾丸逐步达到成年的正常水平（约12ml），阴茎也会逐渐发育至成年后的应有的长度，同时还会出现胡须、阴毛等第二性征。但由于个体体质和成长环境的差异，进入青春期的年龄可能会有所不同，所以男生阴茎小可能是还未进入青春期。
二、隐匿性阴茎。这是指正常的阴茎被埋藏于皮下，外观上阴茎短小，包皮如同鸟嘴包住阴茎，这是阴茎肉膜发育异常导致的先天性畸形。对此可先进行观察，如果在10岁前能够上翻包皮露出龟头，可不进行手术，隐匿性阴茎会随着年龄增长而逐渐好转；如果到10岁时仍然无法上翻包皮，则建议进行隐匿阴茎矫形术，以免影响青春期阴茎的发育。
三、发育异常。例如克氏综合征，这是由于染色体异常引发的一系列症状，主要表现为身材异常、阴茎发育差、睾丸小、无精子等；如果性激素异常，也会导致男生阴茎小。
总之，男生阴茎小应及时到正规医院就诊，查明具体病因并积极治疗，以免延误病情。