牙齿咬合错位会带来多方面危害，比如约30%的错颌畸形患者存在不同程度的咀嚼功能障碍。
影响口腔健康
牙齿磨损： 咬合错位时，牙齿之间的接触关系异常，长期咀嚼过程中，部分牙齿承受的咬合力过大，会加速牙齿表面牙釉质的磨损，严重时可能暴露牙本质，导致牙齿对冷热酸甜等刺激敏感。牙周组织损伤： 不正常的咬合关系会使牙周组织受力不均，容易引发牙龈炎症、牙槽骨吸收等问题，进而出现牙龈红肿、出血，牙齿松动等情况，据统计，咬合错位患者患牙周病的概率比正常咬合者高约2倍。
影响面部美观
面部不对称： 长期的牙齿咬合错位可能会导致面部左右两侧发育不均衡，出现一侧脸大一侧脸小的情况，影响面部的整体美观。比如单侧咀嚼的患者，由于长期只用一侧牙齿咀嚼，患侧面部肌肉相对发达，健侧则相对萎缩，从而造成面部不对称。影响容貌气质： 严重的牙齿咬合错位还可能使下巴位置异常，比如地包天等情况，会改变整个面部的轮廓和比例，给人一种面部不协调的感觉，进而影响个人的容貌气质。
影响消化系统
咀嚼效率降低： 牙齿咬合错位会使牙齿的咀嚼功能受到影响，食物不能被充分咀嚼，加重胃肠道的消化负担。例如，牙齿排列不整齐、咬合关系不良的人，吃较硬的食物时难以嚼碎，食物未经充分咀嚼就进入胃肠道，会影响营养的吸收，长期如此可能导致消化不良、食欲不振等问题。引发胃肠疾病： 由于咀嚼不充分，胃肠道长期处于高负荷的消化状态，容易引发胃肠功能紊乱，甚至可能导致胃炎、胃溃疡等胃肠道疾病的发生风险增加。