月经后三天内进行性生活有可能怀孕，不过几率较小，这主要取决于月经周期是否规律。
一、若月经周期规律，三天后性生活怀孕可能性较小。因为通常卵巢在月经完全干净八至十天后才开始排卵，月经后三天卵巢未排卵就不会怀孕。
二、若月经周期不规律，月经来后三天可能排卵，此时若未做避孕措施，则有怀孕可能。排卵期一般在下次月经前14天左右，所以月经前后一周乃至十天相对安全，没有排卵期，性生活不做措施怀孕几率相对较低。排卵日前5天及排卵日后4天统称排卵期，此阶段易怀孕，要做好避孕措施。
三、精子在女性体内可存活48至72小时甚至更长，若在精子存活期间有卵子排出也可能怀孕。
四、若担心受孕，可口服紧急避孕药，如左炔诺孕酮片和米非司酮片。
五、若发现意外怀孕需终止妊娠，7周内可在医生嘱咐下服用药物流产，之后要注意休养和调理，注意不吃生冷、辛辣食物，多休息。
总之，月经后三天内性生活是否会怀孕受月经周期是否规律等因素影响，需根据具体情况判断，且有相应的应对措施。