脑发育不全的症状较多，常见的有运动发育迟缓，比如宝宝在3个月时还不能抬头，4个月后双手仍紧握拳，不能自主张开等。一般正常宝宝3个月左右就能抬头较好，4个月时手的动作会更灵活。
生长发育方面的症状
身高体重增长缓慢：脑发育不全的孩子往往身高、体重增长速度比正常儿童慢，可能在相同月龄或年龄时，明显低于同龄正常孩子的生长曲线。牙齿发育异常：部分脑发育不全儿童牙齿发育也会出现问题，比如出牙延迟，正常宝宝4 - 10个月开始出牙，而脑发育不全宝宝可能1岁多还未出牙。
智力方面的症状
认知能力落后：患儿对周围环境的认知能力较差，比如1岁左右还不能认识亲人和熟悉的物品，正常宝宝1岁左右能明确认识家人并对常见物品有一定认知。语言发育迟缓：多数脑发育不全儿童语言发育比正常儿童晚，可能1岁多还不会叫爸爸妈妈，正常宝宝1岁左右大多能简单叫爸妈。
神经系统方面的症状
肌张力异常：可表现为肌张力增高或减低。肌张力增高时，孩子肢体僵硬，活动受限；肌张力减低时，肢体松软，像无力状态。比如肌张力增高的孩子穿衣时胳膊难以抬起，肌张力减低的孩子躺着时四肢松软下垂。姿势异常：常见异常姿势，如头后仰、身体扭转、下肢交叉等。正常孩子姿势协调，而脑发育不全孩子会出现这些不符合正常发育规律的异常姿势。