真菌性鼻窦炎手术通常不会太痛苦，这是因为术前医生会对患者实施麻醉，所以在手术过程中患者一般不会有痛苦之感。真菌性鼻窦炎属于较为常见的鼻窦疾病，主要因真菌感染致使鼻窦黏膜产生炎症反应，患者会有鼻塞、流脓涕、头痛等不适表现，当病情较为严重时，患者可依据医嘱选择手术疗法。
一、真菌性鼻窦炎手术多在鼻窦内窥镜下开展，需在鼻腔内做切口，医生会将鼻窦内的真菌团块彻底清除，如此有利于提升手术成功率，降低术后复发几率。术前对患者进行麻醉处理，因而手术时患者通常不会感到痛苦。
二、术后麻醉药效消退后，患者可能会有一定程度的痛苦，但通常在可忍受范围。术后患者要注意按规定时间到医院复查，且可在医生指导下使用生理盐水清洗鼻腔，这样能促进鼻腔内的分泌物排出，有助于保持鼻腔清洁，还能减少鼻腔内细菌滋生，进而缓解不适症状。
三、患者在日常生活中需注重加强体育锻炼，比如跑步、游泳等，可提高身体免疫力，减少真菌性鼻窦炎的发病概率。倘若患者出现鼻塞、流涕等不适症状，建议患者及时前往医院就诊治疗，以免延误病情。
总之，真菌性鼻窦炎手术过程因有麻醉而一般无痛苦，术后虽可能有些许不适但可忍受，患者要做好术后护理和日常保健。