性疾病在潜伏期不一定都能被检测出来，这需要依据性疾病的具体类型来判断，不同性疾病存在较大差异。我国规定的性传播疾病主要涵盖沙眼衣原体感染、尖锐湿疣、生殖器疱疹、淋病、梅毒和艾滋病这6种。
一、沙眼衣原体感染：其潜伏期是1至3周，可引发男性尿道炎以及女性黏液性宫颈炎，不过有超过50%的患者没有症状，即便无症状的患者在潜伏期后也是能够被检测出来的。
二、尖锐湿疣：潜伏期通常为1至8个月，平均是3个月，一般只有出现症状后才可以明确诊断。可依据病史和典型临床表现来诊断本病，要是皮损不典型，还可借助醋酸白试验、HPV检测以及组织病理检查来明确。
三、生殖器疱疹：初发性生殖器疱疹的潜伏期为2至14天，在潜伏期大致能检测出来，但检出率不算高。亚临床型生殖器疱疹虽没有明显临床表现，但也是可以检测出来的。
四、淋病：淋病潜伏期短且传染性强，一般为2至10天，平均3至5天，当前的检测方法灵敏度较高，在潜伏期通常可通过尿道口分泌物涂片或培养检测出来。
五、梅毒：梅毒潜伏期约为2至3周，潜伏期不一定能检测出来。梅毒感染后2至3周会开始出现硬下疳和硬化性淋巴管炎，此时尽管不一定能通过梅毒血清学试验确诊，但医生可依据病史、症状和梅毒螺旋体直接镜检来明确诊断。然而有一部分梅毒患者属于没有任何症状的潜伏梅毒患者，这可以通过梅毒血清学试验检测出来。
六、艾滋病：HIV抗体检测的窗口期，一般在高危行为后2周至3个月不等，在窗口期内有一定的检出率，过了窗口期后，即便没有任何临床症状，通过HIV检测也能检测出来。
总之，不同的性疾病在潜伏期的检测情况各异，需要根据具体疾病来具体分析和判断。