一、感染风险增加
经期第三天时，女性宫颈口处于相对开放状态，此时同房容易使外界细菌等病原体侵入阴道、子宫颈甚至子宫、输卵管等部位。因为经血是细菌等微生物良好的培养基，会为病原体的滋生提供有利环境。研究表明，经期同房女性发生盆腔炎的风险显著高于非经期同房者。盆腔炎若不及时有效治疗，可能会导致输卵管粘连、阻塞，进而影响受孕，对有生育计划的女性影响较大，同时还可能出现慢性盆腔痛等长期不适症状。对于不同年龄的女性，青春期女性生殖系统尚未完全发育成熟，经期同房感染风险相对更高；育龄期女性若发生盆腔炎还可能影响正常妊娠；围绝经期女性生殖系统防御功能下降，感染后更易引发严重并发症。
二、月经异常
同房的机械刺激可能会导致子宫收缩，从而使宫腔内的经血逆流。经血逆流可能会引起子宫内膜异位症，子宫内膜异位症常见症状有痛经进行性加重、月经失调等。部分女性可能出现月经量增多、经期延长等情况。对于年龄较小的青春期女性，月经本身尚不稳定，经期同房更容易打乱月经周期，导致月经紊乱；而对于已经建立稳定月经周期的女性，也可能出现月经周期、经量等方面的改变，影响正常生活和工作。
三、免疫功能短暂下降影响
经期女性身体的免疫功能会有一定程度的变化，经期同房可能会进一步干扰免疫系统的正常功能。此时女性身体相对较为虚弱，抵抗力下降，同房后感染疾病的几率增加。不同生活方式的女性，比如长期熬夜、缺乏运动的女性，本身免疫功能可能相对较弱，经期同房后免疫功能受影响更明显，更容易出现感冒等感染性疾病；而生活方式健康、经常运动的女性，相对来说免疫功能受影响程度可能稍轻，但也不能完全避免出现免疫相关的不适。对于有基础病史的女性，比如本身有免疫系统疾病的女性，经期同房可能会加重病情或诱发疾病发作，需要特别注意避免在经期同房。