慢性肠炎的最佳治疗方法主要是以对症处理为主。具体如下：
一、饮食方面。建议病人进食清淡饮食，要少吃辛辣刺激性食物和难以消化的食物，同时尽量减少在外进餐。清淡饮食有助于减轻肠道负担，而辛辣刺激和难消化的食物可能会刺激肠道，引发不适或加重症状，减少在外进餐则可降低感染一些肠道疾病的风险。
二、药物治疗。如果慢性肠炎患者是以腹痛为主或腹泻为主，可口服双歧杆菌四联活菌片、马来酸曲美布汀等药物来缓解症状，部分病人也可以口服肠胃康分散片等中成药以达到缓解症状的目的。双歧杆菌四联活菌片能调节肠道菌群，马来酸曲美布汀可改善胃肠功能紊乱，肠胃康分散片对肠胃功能也有一定的调节作用。
三、诊断建议。不能盲目地认为所有的腹痛、腹泻都是慢性肠炎，一定要排除肠道的其他疾病，所以一般在认定是慢性肠炎之前都建议做一个常规肠镜检查。通过肠镜检查可以更清楚地观察肠道内部情况，明确诊断，避免误诊和漏诊。
总之，对于慢性肠炎，要注重对症治疗，同时注意饮食，并准确诊断以排除其他肠道疾病。