三个月宝宝流清水鼻涕通常是因受凉感冒致风寒阻碍气机。可通过如下方式处理，症状严重则需及时就诊治疗。具体如下：
一、毛巾热敷：宝宝流清水鼻涕时，家长可用干净毛巾或纱布蘸热水并拧干层层裹好，放于宝宝鼻根处，因婴儿皮肤娇嫩要防烫伤；另外可每晚给宝宝温水泡脚，利于祛寒。
1.原理：通过热毛巾敷鼻根，可促进鼻部血液循环，缓解鼻部不适；温水泡脚能帮助驱除宝宝体内的寒气。
2.注意事项：毛巾温度要适宜，避免烫伤宝宝皮肤。
二、局部按摩：宝宝流清水鼻涕可进行按摩治疗。
1.具体穴位：通常对合谷穴、涌泉穴、曲池穴等部位进行按摩。
2.作用：能较好地疏通经络，有助于改善宝宝流清水鼻涕症状。
三、及时就诊：若症状严重，应及时去医院。
1.药物治疗：可在医生指导下服用疏风散寒的药物，如小柴胡颗粒、小儿感冒颗粒、小儿氨酚黄那敏颗粒等中成药，利于病情恢复。
2.日常护理：家长要根据天气变化及时给宝宝添加衣物，以防加重病情。
总之，当三个月宝宝出现流清水鼻涕时，可先尝试毛巾热敷、局部按摩等方法，若症状持续不缓解或加重，要及时就医，在医生指导下进行治疗和护理。