尿尿时阴茎疼可能是由多种因素引起的，包括局部损伤、尿道炎、前列腺炎、包皮龟头炎、尿道结石等，同时可能还伴有尿频、尿急等症状，需要及时就医并遵医嘱进行针对性治疗。
一、局部损伤：
1.过度挤压、受到外力撞击等因素，有可能致使尿道或尿道口部位受损。
2.在排尿过程中，受损部位受到尿液刺激，就会引发尿尿时阴茎疼的状况。
3.可使用止痛类药物如双氯芬酸钠肠溶片、布洛芬片等以及抗感染药物如头孢地尼分散片等来进行治疗。
二、尿道炎：
1.细菌性尿道炎或淋菌性尿道炎等，会导致尿道局部受损，进而引起尿尿时阴茎疼。
2.还常伴有尿频、尿急等症状，可使用敏感抗生素类药物进行治疗，如西他沙星片、头孢克洛片、左氧氟沙星片等。
三、前列腺炎：
1.可能与频繁手淫、不洁性生活等因素相关，导致感染发生。
2.由于局部炎症持续破坏刺激前列腺，引起局部损伤及充血，从而可能导致尿尿时阴茎疼。
3.还可能伴有尿不尽、尿频、会阴部胀痛等症状，可使用西他沙星、盐酸坦索罗辛缓释胶囊等药物进行治疗，并配合微波理疗、热疗等物理疗法。
四、包皮龟头炎：
1.可因感染、包皮过长、局部刺激等因素诱发。
2.男性存在包皮龟头炎时，可能会侵犯尿道口部位，使尿道口部位受损，容易引起尿尿时阴茎疼。
3.还可伴有瘙痒等症状，可使用高锰酸钾进行湿敷。如果是细菌性包皮龟头炎，可使用莫匹罗星软膏、氧氟沙星等；如果是滴虫性包皮龟头炎，可使用甲硝唑、替硝唑；如果是念珠菌性包皮龟头炎，可使用曲安奈德益康唑乳膏、伊曲康唑等药物进行治疗。
五、尿道结石：
1.通常继发于膀胱结石。
2.在排尿时，由于尿道受到结石的刺激，会引起尿尿时阴茎疼，疼痛往往较为剧烈。
3.还可能伴有排尿困难等症状，确诊后应进行相应的排石处理，如尿道激光碎石术、尿道结石取石术等。
总之，当出现尿尿时阴茎疼的情况时，一定要及时就医，明确病因后进行针对性治疗，以避免病情加重，影响身体健康。