斑秃的发生是多种因素共同作用的结果。遗传因素是其中一个重要方面，约25%的斑秃患者有家族史，也就是说每4个斑秃患者中大概有1个有家族遗传背景。
遗传因素相关
基因关联：研究发现，某些特定基因的突变与斑秃的易感性有关。比如白细胞介素相关基因等，这些基因的异常可能使机体免疫系统更容易攻击毛囊，导致斑秃发生。家族聚集性：如果家族中有直系亲属患斑秃，那么其他家庭成员患斑秃的风险会比普通人群高。如果一级亲属（父母、子女、兄弟姐妹）中有斑秃患者，个体患斑秃的风险大约是普通人的2 - 3倍。
免疫系统异常导致
自身免疫攻击：人体免疫系统错误地将毛囊当成了外来异物进行攻击。正常情况下，免疫系统保护身体免受病原体侵害，但在斑秃患者体内，免疫系统的T淋巴细胞等攻击毛囊周围的组织，影响毛囊的正常生长周期，使得毛囊进入休止期，头发就会脱落。其他自身免疫病关联：斑秃患者常合并其他自身免疫性疾病，像甲状腺疾病，约有10% - 20%的斑秃患者同时患有甲状腺功能亢进或减退等甲状腺疾病。这是因为自身免疫机制在不同器官组织间有交叉反应，免疫系统的紊乱波及到了毛囊和甲状腺等不同部位。
神经精神因素影响
压力与情绪：长期的精神压力过大、焦虑、抑郁等情绪问题可能诱发斑秃。例如，当人处于长期高强度工作、生活重大变故等情况时，身体会分泌一些应激激素，如皮质醇等，这些激素会影响毛囊的生长周期。有调查显示，在突发重大生活事件后的3 - 6个月内，斑秃的发病率会明显升高。睡眠质量：睡眠不足或睡眠质量差也与斑秃有关。睡眠过程中身体会进行自我修复和调节，包括毛囊的营养供应和代谢等。长期睡眠障碍会干扰毛囊的正常代谢，导致毛囊功能异常，引发斑秃。研究发现，每晚睡眠不足6小时的人群，患斑秃的概率比睡眠充足人群高约1.5倍。