尿路感染反复发作可能有多种原因。据统计，约有50%的女性在一生中至少会发生一次尿路感染，而部分女性会出现反复发作的情况。
病原体持续存在
细菌未彻底清除： 当首次发生尿路感染时，如果没有规范、足量地使用抗生素治疗，可能导致细菌没有被完全杀灭，残留的细菌就可能再次繁殖引发感染。比如，有的患者在出现尿频、尿急等尿路感染症状后，自行服用了几天抗生素，感觉症状缓解就停药了，这时候可能有少量细菌存活，后续就容易复发。耐药菌感染： 长期不合理使用抗生素，会使细菌产生耐药性。例如，一些患者在多次感染后反复使用同一种抗生素，导致细菌对该抗生素耐药，从而使得治疗效果不佳，容易让尿路感染反复发作。
泌尿系统结构或功能异常
尿路梗阻： 像尿路结石、前列腺增生等情况都可能引起尿路梗阻。如果存在尿路梗阻，尿液排出不畅，细菌就容易在局部繁殖，而且难以被清除，从而导致尿路感染反复发生。比如，有前列腺增生的男性患者，尿液排出受阻，就比较容易出现尿路感染反复发作的情况。膀胱输尿管反流： 这是一种先天性或后天性的泌尿系统结构异常，尿液从膀胱反流至输尿管甚至肾盂，使得细菌容易在肾脏等部位定植，进而引发反复的尿路感染。儿童时期如果存在膀胱输尿管反流，就可能频繁出现尿路感染。
机体免疫力低下
糖尿病患者： 糖尿病患者由于血糖水平较高，有利于细菌生长繁殖，而且自身免疫力相对较低，容易发生尿路感染，并且一旦发生，也更容易反复发作。据研究，糖尿病患者发生尿路感染的概率比非糖尿病患者高很多，且复发率也较高。长期使用免疫抑制剂者： 比如器官移植后长期使用免疫抑制剂的患者，其机体的免疫功能受到抑制，对细菌的抵抗力下降，容易反复发生尿路感染。这类患者即使短期使用抗生素控制了一次感染，但由于免疫力低下，很容易再次感染。